Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TULP4Q9NRJ4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms