Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FBXO8Q9NRD0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms