Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
USP44Q9H0E7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP44Q9H0E7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms