Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1EQ9GZS1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms