Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTNAP4Q9C0A0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTNAP4Q9C0A0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms