Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM175Q9BSA9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms