Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms