Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R9BQ96SB3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R9BQ96SB3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PPP1R9BQ96SB3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms