Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms