Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms