Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM47Q96LD4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms