Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC35A4Q96G79 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms