Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms