Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms