Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
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TRIM63Q969Q1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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TRIM63Q969Q1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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TRIM63Q969Q1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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TRIM63Q969Q1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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TRIM63Q969Q1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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