Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-CQ95604 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms