Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF25Q93038 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF25Q93038 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF25Q93038 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF25Q93038 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF25Q93038 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF25Q93038 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF25Q93038 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF25Q93038 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF25Q93038 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF25Q93038 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF25Q93038 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF25Q93038 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF25Q93038 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF25Q93038 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF25Q93038 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFRSF25Q93038 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFRSF25Q93038 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25Q93038 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms