Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVR3

C7orf43, Uncharacterized protein C7orf43, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43Q8WVR3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C7orf43Q8WVR3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf43Q8WVR3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms