Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COLGALT1Q8NBJ5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms