Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms