Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms