Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms