Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms