Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms