Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD54Q6NXT1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms