Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCSD1Q6JBY9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms