Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms