Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LDLRAP1Q5SW96 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms