Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms