Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKDCCQ504Y2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms