Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDSNQ15517 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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