Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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SIX1Q15475 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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SIX1Q15475 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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SIX1Q15475 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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SIX1Q15475 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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SIX1Q15475 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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SIX1Q15475 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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SIX1Q15475 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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SIX1Q15475 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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SIX1Q15475 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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SIX1Q15475 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIX1Q15475 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIX1Q15475 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIX1Q15475 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIX1Q15475 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIX1Q15475 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIX1Q15475 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIX1Q15475 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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SIX1Q15475 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SIX1Q15475 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIX1Q15475 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIX1Q15475 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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