Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL1Q13616 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL1Q13616 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL1Q13616 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL1Q13616 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL1Q13616 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL1Q13616 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL1Q13616 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL1Q13616 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL1Q13616 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL1Q13616 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL1Q13616 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL1Q13616 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL1Q13616 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL1Q13616 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL1Q13616 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL1Q13616 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CUL1Q13616 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL1Q13616 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL1Q13616 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL1Q13616 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL1Q13616 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CUL1Q13616 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL1Q13616 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL1Q13616 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL1Q13616 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL1Q13616 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL1Q13616 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL1Q13616 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL1Q13616 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL1Q13616 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL1Q13616 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL1Q13616 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL1Q13616 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL1Q13616 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL1Q13616 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL1Q13616 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL1Q13616 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL1Q13616 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL1Q13616 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL1Q13616 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL1Q13616 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL1Q13616 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CUL1Q13616 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CUL1Q13616 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL1Q13616 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL1Q13616 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL1Q13616 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL1Q13616 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL1Q13616 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL1Q13616 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CUL1Q13616 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL1Q13616 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL1Q13616 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL1Q13616 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL1Q13616 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL1Q13616 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL1Q13616 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL1Q13616 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL1Q13616 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL1Q13616 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL1Q13616 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL1Q13616 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL1Q13616 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL1Q13616 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CUL1Q13616 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL1Q13616 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL1Q13616 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL1Q13616 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL1Q13616 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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