Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms