Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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