Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 PHO80YOL001W 882 nt2.75□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 KAR9YPL269W 1935 nt2.75□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 GCD10YNL062C 1437 nt2.75□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 DAL5YJR152W 1632 nt2.75□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YKL100CYKL100C 1764 nt2.74□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 PDS5YMR076C 3834 nt2.74□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 UFD4YKL010C 4452 nt2.74□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 TOP2YNL088W 4287 nt2.74□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 MET32YDR253C 576 nt2.74□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YLR252WYLR252W 306 nt2.74□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.74□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.74□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 SFM1YOR021C 642 nt2.74□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YPL276WYPL276W 438 nt2.74□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 TRA1YHR099W 11235 nt2.74□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.74□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.74□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.74□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.74□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.74□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YCL019WYCL019W 5313 nt2.74□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 SPR3YGR059W 1539 nt2.73□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 DBF20YPR111W 1695 nt2.73□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.73□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YNL043CYNL043C 321 nt2.73□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 KHA1YJL094C 2622 nt2.73□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 SSD1YDR293C 3753 nt2.73□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 URB2YJR041C 3525 nt2.73□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 PHO2YDL106C 1680 nt2.73□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YER138CYER138C 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YER160CYER160C 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YJR027WYJR027W 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YML039WYML039W 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YML045WYML045W 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YMR050CYMR050C 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 AHC2YCR082W 387 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YDR199WYDR199W 366 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YFL019CYFL019C 354 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 TIM10YHR005C-A 282 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 SSP1YHR184W 1716 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 VPS51YKR020W 495 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 DAD2YKR083C 402 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 SPC29YPL124W 762 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YPR096CYPR096C 303 nt2.72□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YCK2YNL154C 1641 nt2.71□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 FKS3YMR306W 5358 nt2.71□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 TMN3YER113C 2121 nt2.71□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 AVT2YEL064C 1443 nt2.71□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 YGR242WYGR242W 309 nt2.71□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 MCR1YKL150W 909 nt2.71□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 CDC123YLR215C 1083 nt2.71□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.71□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 VID24YBR105C 1089 nt2.71□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 RRI2YOL117W 1938 nt2.71□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 JJJ2YJL162C 1752 nt2.71□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 YRR1YOR162C 2433 nt2.71□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 BNR1YIL159W 4128 nt2.7□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 DSE4YNR067C 3354 nt2.7□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 YDL009CYDL009C 324 nt2.7□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 MBB1YJL199C 327 nt2.7□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 EMC6YLL014W 327 nt2.7□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 COA4YLR218C 453 nt2.7□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 PRE8YML092C 753 nt2.7□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 YMR144WYMR144W 1029 nt2.7□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 NGL1YOL042W 1092 nt2.7□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 TOA1YOR194C 861 nt2.7□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 ORC2YBR060C 1863 nt2.7□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 AI2Q0055 2565 nt2.7□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 ATP22YDR350C 2055 nt2.7□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 RRP12YPL012W 3687 nt2.69□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 CSF1YLR087C 8877 nt2.69□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 PSD2YGR170W 3417 nt2.69□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 SOK1YDR006C 2706 nt2.69□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 GET1YGL020C 708 nt2.69□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 YGL042CYGL042C 306 nt2.69□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 RPL9AYGL147C 576 nt2.69□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 TCD1YHR003C 1290 nt2.69□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 YIL054WYIL054W 318 nt2.69□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 RRT16YNL105W 429 nt2.69□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 HEM4YOR278W 828 nt2.69□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 ISU1YPL135W 498 nt2.69□□□□□ -1.98
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