Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD47Q08722 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD47Q08722 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD47Q08722 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD47Q08722 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD47Q08722 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD47Q08722 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CD47Q08722 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD47Q08722 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD47Q08722 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD47Q08722 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD47Q08722 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD47Q08722 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD47Q08722 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD47Q08722 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD47Q08722 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD47Q08722 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD47Q08722 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD47Q08722 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD47Q08722 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD47Q08722 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CD47Q08722 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD47Q08722 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD47Q08722 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD47Q08722 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD47Q08722 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CD47Q08722 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD47Q08722 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD47Q08722 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD47Q08722 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD47Q08722 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD47Q08722 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD47Q08722 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD47Q08722 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD47Q08722 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD47Q08722 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD47Q08722 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD47Q08722 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD47Q08722 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD47Q08722 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD47Q08722 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD47Q08722 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD47Q08722 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD47Q08722 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD47Q08722 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD47Q08722 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD47Q08722 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD47Q08722 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD47Q08722 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD47Q08722 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD47Q08722 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD47Q08722 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms