Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PUDPQ08623 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms