Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFF3Q07654 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms