Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms