Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTD2P86397 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTD2P86397 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTD2P86397 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTD2P86397 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTD2P86397 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTD2P86397 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTD2P86397 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTD2P86397 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTD2P86397 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTD2P86397 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTD2P86397 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTD2P86397 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTD2P86397 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HTD2P86397 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTD2P86397 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTD2P86397 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTD2P86397 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTD2P86397 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTD2P86397 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTD2P86397 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTD2P86397 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTD2P86397 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTD2P86397 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTD2P86397 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTD2P86397 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTD2P86397 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTD2P86397 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTD2P86397 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTD2P86397 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTD2P86397 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTD2P86397 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTD2P86397 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTD2P86397 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HTD2P86397 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HTD2P86397 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HTD2P86397 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HTD2P86397 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HTD2P86397 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HTD2P86397 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTD2P86397 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTD2P86397 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTD2P86397 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTD2P86397 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTD2P86397 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTD2P86397 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTD2P86397 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTD2P86397 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTD2P86397 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HTD2P86397 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTD2P86397 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HTD2P86397 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HTD2P86397 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HTD2P86397 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HTD2P86397 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HTD2P86397 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HTD2P86397 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTD2P86397 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTD2P86397 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTD2P86397 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HTD2P86397 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HTD2P86397 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTD2P86397 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTD2P86397 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTD2P86397 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTD2P86397 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTD2P86397 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTD2P86397 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTD2P86397 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTD2P86397 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTD2P86397 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTD2P86397 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HTD2P86397 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms