Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms