Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP107P57740 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP107P57740 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP107P57740 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP107P57740 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP107P57740 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP107P57740 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP107P57740 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP107P57740 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP107P57740 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP107P57740 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP107P57740 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP107P57740 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP107P57740 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP107P57740 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP107P57740 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP107P57740 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP107P57740 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP107P57740 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP107P57740 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP107P57740 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP107P57740 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP107P57740 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP107P57740 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP107P57740 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP107P57740 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP107P57740 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP107P57740 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP107P57740 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP107P57740 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP107P57740 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP107P57740 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP107P57740 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP107P57740 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP107P57740 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP107P57740 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP107P57740 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP107P57740 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP107P57740 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms