Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1P56182 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1P56182 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1P56182 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP1P56182 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP1P56182 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP1P56182 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP1P56182 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP1P56182 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP1P56182 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP1P56182 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP1P56182 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP1P56182 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP1P56182 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP1P56182 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP1P56182 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1P56182 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1P56182 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1P56182 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1P56182 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1P56182 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1P56182 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1P56182 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1P56182 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1P56182 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1P56182 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1P56182 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1P56182 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1P56182 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1P56182 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1P56182 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1P56182 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1P56182 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1P56182 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1P56182 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1P56182 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1P56182 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1P56182 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1P56182 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1P56182 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1P56182 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1P56182 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1P56182 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1P56182 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1P56182 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1P56182 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1P56182 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1P56182 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1P56182 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1P56182 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RRP1P56182 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RRP1P56182 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RRP1P56182 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RRP1P56182 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1P56182 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1P56182 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1P56182 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1P56182 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1P56182 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1P56182 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1P56182 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1P56182 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1P56182 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1P56182 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1P56182 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1P56182 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1P56182 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1P56182 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1P56182 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1P56182 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1P56182 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1P56182 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1P56182 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1P56182 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1P56182 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1P56182 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP1P56182 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP1P56182 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP1P56182 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP1P56182 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP1P56182 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP1P56182 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP1P56182 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP1P56182 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP1P56182 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP1P56182 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP1P56182 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP1P56182 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP1P56182 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP1P56182 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP1P56182 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP1P56182 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP1P56182 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP1P56182 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP1P56182 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP1P56182 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP1P56182 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP1P56182 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP1P56182 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP1P56182 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms