Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL23P55773 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL23P55773 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL23P55773 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL23P55773 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL23P55773 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL23P55773 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL23P55773 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL23P55773 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL23P55773 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL23P55773 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL23P55773 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL23P55773 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL23P55773 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL23P55773 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL23P55773 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL23P55773 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL23P55773 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL23P55773 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL23P55773 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL23P55773 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCL23P55773 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL23P55773 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL23P55773 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL23P55773 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL23P55773 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL23P55773 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL23P55773 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL23P55773 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL23P55773 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL23P55773 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL23P55773 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL23P55773 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL23P55773 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL23P55773 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL23P55773 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL23P55773 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL23P55773 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL23P55773 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL23P55773 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL23P55773 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL23P55773 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL23P55773 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL23P55773 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL23P55773 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL23P55773 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL23P55773 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL23P55773 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL23P55773 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL23P55773 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL23P55773 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL23P55773 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL23P55773 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL23P55773 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL23P55773 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL23P55773 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL23P55773 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL23P55773 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL23P55773 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL23P55773 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL23P55773 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL23P55773 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL23P55773 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL23P55773 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL23P55773 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL23P55773 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL23P55773 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL23P55773 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL23P55773 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL23P55773 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL23P55773 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL23P55773 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL23P55773 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL23P55773 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL23P55773 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL23P55773 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL23P55773 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL23P55773 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms