Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	EDS1	YBR033W	2760 nt		2.57	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YOL098C	YOL098C	3114 nt		2.57	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YDR133C	YDR133C	336 nt		2.57	□□□□□ -2
DSL1	P53847	PRE1	YER012W	597 nt		2.57	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YMR31	YFR049W	372 nt		2.57	□□□□□ -2
DSL1	P53847	PAU23	YLR037C	375 nt		2.57	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YLR252W	YLR252W	306 nt		2.57	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YNR021W	YNR021W	1215 nt		2.57	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YNR034W-A	YNR034W-A	297 nt		2.57	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YOR343W-A	YOR343W-A	1317 nt		2.57	□□□□□ -2
DSL1	P53847	BFR1	YOR198C	1413 nt		2.57	□□□□□ -2
DSL1	P53847	NEW1	YPL226W	3591 nt		2.56	□□□□□ -2
DSL1	P53847	DBP10	YDL031W	2988 nt		2.56	□□□□□ -2
DSL1	P53847	NMA111	YNL123W	2994 nt		2.56	□□□□□ -2
DSL1	P53847	FYV4	YHR059W	393 nt		2.56	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YKL165C-A	YKL165C-A	234 nt		2.56	□□□□□ -2
DSL1	P53847	BER1	YLR412W	825 nt		2.56	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YMR013C-A	YMR013C-A	150 nt		2.56	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YOL013W-B	YOL013W-B	291 nt		2.56	□□□□□ -2
DSL1	P53847	DAD3	YBR233W-A	285 nt		2.56	□□□□□ -2
DSL1	P53847	GDI1	YER136W	1356 nt		2.56	□□□□□ -2
DSL1	P53847	SWA2	YDR320C	2007 nt		2.56	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YPK1	YKL126W	2043 nt		2.56	□□□□□ -2
DSL1	P53847	SEC16	YPL085W	6588 nt		2.56	□□□□□ -2
DSL1	P53847	MRP10	YDL045W-A	288 nt		2.55	□□□□□ -2
DSL1	P53847	tF(GAA)D	tF(GAA)D	73 nt		2.55	□□□□□ -2
DSL1	P53847	tF(GAA)N	tF(GAA)N	73 nt		2.55	□□□□□ -2
DSL1	P53847	MTC7	YEL033W	420 nt		2.55	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YHR180W-A	YHR180W-A	183 nt		2.55	□□□□□ -2
DSL1	P53847	RRI2	YOL117W	1938 nt		2.55	□□□□□ -2
DSL1	P53847	PHR1	YOR386W	1698 nt		2.55	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YPR096C	YPR096C	303 nt		2.55	□□□□□ -2
DSL1	P53847	SUL1	YBR294W	2580 nt		2.55	□□□□□ -2
DSL1	P53847	NPR3	YHL023C	3441 nt		2.54	□□□□□ -2
DSL1	P53847	AHC2	YCR082W	387 nt		2.54	□□□□□ -2
DSL1	P53847	MPO1	YGL010W	525 nt		2.54	□□□□□ -2
DSL1	P53847	PRM8	YGL053W	714 nt		2.54	□□□□□ -2
DSL1	P53847	CIC1	YHR052W	1131 nt		2.54	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YLR456W	YLR456W	615 nt		2.54	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YML037C	YML037C	1023 nt		2.54	□□□□□ -2
DSL1	P53847	RRG8	YPR116W	834 nt		2.54	□□□□□ -2
DSL1	P53847	FIR1	YER032W	2631 nt		2.54	□□□□□ -2
DSL1	P53847	SPR3	YGR059W	1539 nt		2.53	□□□□□ -2
DSL1	P53847	SIN3	YOL004W	4611 nt		2.53	□□□□□ -2
DSL1	P53847	DFG10	YIL049W	762 nt		2.53	□□□□□ -2
DSL1	P53847	VPS51	YKR020W	495 nt		2.53	□□□□□ -2
DSL1	P53847	RPL19B	YBL027W	570 nt		2.53	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YMR316C-A	YMR316C-A	312 nt		2.53	□□□□□ -2
DSL1	P53847	ATP19	YOL077W-A	207 nt		2.53	□□□□□ -2
DSL1	P53847	HSP10	YOR020C	321 nt		2.53	□□□□□ -2
DSL1	P53847	SNF12	YNR023W	1701 nt		2.53	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YHR078W	YHR078W	1659 nt		2.53	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YPL150W	YPL150W	2706 nt		2.52	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YRB1	YDR002W	606 nt		2.52	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	GPI19	YDR437W	423 nt		2.52	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	ERV1	YGR029W	570 nt		2.52	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YGR290W	YGR290W	444 nt		2.52	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	PET191	YJR034W	327 nt		2.52	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	RPL8B	YLL045C	771 nt		2.52	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	HHT2	YNL031C	411 nt		2.52	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	PHO80	YOL001W	882 nt		2.52	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	RPL25	YOL127W	429 nt		2.52	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	ARR2	YPR200C	393 nt		2.52	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	UBP16	YPL072W	1500 nt		2.52	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	MES1	YGR264C	2256 nt		2.52	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YBL005W-B	YBL005W-B	5268 nt		2.52	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	APC2	YLR127C	2562 nt		2.52	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	SWR1	YDR334W	4545 nt		2.51	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	MET32	YDR253C	576 nt		2.51	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YLR302C	YLR302C	363 nt		2.51	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	SAS2	YMR127C	1017 nt		2.51	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YOL134C	YOL134C	390 nt		2.51	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YOL150C	YOL150C	312 nt		2.51	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	OST2	YOR103C	393 nt		2.51	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	GAL7	YBR018C	1101 nt		2.51	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YPL034W	YPL034W	498 nt		2.51	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	DNL4	YOR005C	2835 nt		2.51	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	SNU56	YDR240C	1479 nt		2.51	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	SSF1	YHR066W	1362 nt		2.5	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	ARP8	YOR141C	2646 nt		2.5	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YDR090C	YDR090C	933 nt		2.5	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YER107W-A	YER107W-A	321 nt		2.5	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YGL015C	YGL015C	393 nt		2.5	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YGR018C	YGR018C	330 nt		2.5	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	EAF6	YJR082C	342 nt		2.5	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YKR051W	YKR051W	1257 nt		2.5	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	BET3	YKR068C	582 nt		2.5	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YHC1	YLR298C	696 nt		2.5	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	MRPL44	YMR225C	297 nt		2.5	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	VMA9	YCL005W-A	222 nt		2.5	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	GCV2	YMR189W	3105 nt		2.5	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	STH1	YIL126W	4080 nt		2.5	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	POM152	YMR129W	4014 nt		2.49	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	COG3	YER157W	2406 nt		2.49	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	BI4	Q0120	1917 nt		2.49	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	TIM9	YEL020W-A	264 nt		2.49	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YGR045C	YGR045C	363 nt		2.49	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YAL026C-A	YAL026C-A	438 nt		2.49	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YKL044W	YKL044W	321 nt		2.49	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	AFB1	YLR040C	675 nt		2.49	□□□□□ -2.01

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