Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR1P51861 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR1P51861 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR1P51861 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR1P51861 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR1P51861 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR1P51861 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR1P51861 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR1P51861 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR1P51861 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR1P51861 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR1P51861 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR1P51861 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR1P51861 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR1P51861 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR1P51861 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR1P51861 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR1P51861 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR1P51861 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR1P51861 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR1P51861 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR1P51861 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR1P51861 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR1P51861 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR1P51861 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR1P51861 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR1P51861 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR1P51861 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR1P51861 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR1P51861 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR1P51861 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR1P51861 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR1P51861 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR1P51861 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR1P51861 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR1P51861 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR1P51861 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR1P51861 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR1P51861 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR1P51861 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR1P51861 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR1P51861 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR1P51861 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR1P51861 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR1P51861 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR1P51861 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR1P51861 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR1P51861 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR1P51861 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR1P51861 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR1P51861 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR1P51861 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR1P51861 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR1P51861 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR1P51861 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR1P51861 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR1P51861 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms