Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms