Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TMPOP42166 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMPOP42166 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMPOP42166 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMPOP42166 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMPOP42166 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMPOP42166 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMPOP42166 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMPOP42166 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMPOP42166 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMPOP42166 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMPOP42166 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMPOP42166 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMPOP42166 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMPOP42166 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMPOP42166 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMPOP42166 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMPOP42166 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMPOP42166 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMPOP42166 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMPOP42166 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMPOP42166 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMPOP42166 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMPOP42166 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMPOP42166 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMPOP42166 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMPOP42166 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMPOP42166 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMPOP42166 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMPOP42166 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMPOP42166 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMPOP42166 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMPOP42166 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMPOP42166 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMPOP42166 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMPOP42166 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMPOP42166 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TMPOP42166 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMPOP42166 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMPOP42166 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TMPOP42166 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TMPOP42166 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMPOP42166 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMPOP42166 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMPOP42166 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMPOP42166 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMPOP42166 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMPOP42166 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMPOP42166 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMPOP42166 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMPOP42166 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMPOP42166 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMPOP42166 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMPOP42166 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMPOP42166 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMPOP42166 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TMPOP42166 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TMPOP42166 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMPOP42166 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMPOP42166 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMPOP42166 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMPOP42166 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMPOP42166 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMPOP42166 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMPOP42166 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMPOP42166 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMPOP42166 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMPOP42166 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMPOP42166 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TMPOP42166 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMPOP42166 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMPOP42166 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMPOP42166 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMPOP42166 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMPOP42166 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMPOP42166 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMPOP42166 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMPOP42166 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMPOP42166 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMPOP42166 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TMPOP42166 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMPOP42166 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMPOP42166 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMPOP42166 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMPOP42166 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMPOP42166 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMPOP42166 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMPOP42166 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMPOP42166 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TMPOP42166 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMPOP42166 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMPOP42166 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMPOP42166 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMPOP42166 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TMPOP42166 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMPOP42166 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMPOP42166 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMPOP42166 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMPOP42166 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMPOP42166 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms