Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF9P41273 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms